火山图

热图 heatmap

瀑布图 waterfall plot

富集分析气泡图 bubble chart

基因集富集分析 GSEA

基因表达趋势分析图

主成分分析图 Principle Component Analysis （PCA）

相关性分析散点图 Scatter plot

相互作用网络分析图 interaction network

circos图

桑基图 Sankey diagram

森林图 Forest plot

风险评估 risk score

生存曲线 Kaplan Meier

ROC曲线图 receiver operating characteristic curve

曼哈顿图 Manhattan plot

箱线图

小提琴图

抖动图 jitter plot

云雨图 Raincloud Plot

维恩图 venn

upset图

旭日图 Sunburst chart

雷达图 radar plot

直方图 histogram

密度图

流式细胞图

转录因子结合模体 Transcription Factor Binding Motifs (TFBMs)

图标讲解

<aside> 🍁 绘图代码 & 网站

r-graph-gallery.com

CNSknowall

https://www.bilibili.com/video/BV1AC4y1Y793/?spm_id_from=333.788.recommend_more_video.16

UCASMED_BioInfo_0309.pdf

</aside>

数据的五种关系 构成：占总体的百分比 比较：项目的排名 趋势：如何随着时间变化 分布：项目的频率情况 联系：变量之间的关系

<aside> 🎫 以下四种基本视觉元素来展现图形：

• 点：scatter plot 二维数据，适用于简单二维关系；
• 线：line plot 二维数据，适用于时间序列；
• 柱状：bar plot 二维数据，适用于类别统计；
• 颜色：heatmap 适用于展示第三维度； </aside>

<aside> 🎫 常用的数据转换方法：

• 合并：merge，concat，combine_frist(类似于数据库中的全外连接)
• 重塑：reshape；轴向旋转：pivot（类似excel数据透视表）
• 去重：drop_duplicates
• 映射：map
• 填充替换：fillna,replace
• 重命名轴索引：rename </aside>

类别比较类图形

数值关系类图形

数据分布类图形

时间序列类图形

局部整体类图形