用途：展示分布状态；eg：芯片、RNA-seq分析

• 评估两组数据的一个总体的分布趋势（不同样本之间的集中趋势、表达量的相关性）
• 评估重复样本的重复性（一个样本通常要做三次- - -任意两次数据做相关性分析：如果都集中在对角线上→说明两个样本相关性非常好，实验重复性好，实验没有问题）

散点图是用两组数据构成多个坐标点，考察坐标点的分布，判断两变量之间是否存在某种关联（一般用于相关性分析- - -相关系数r）或总结坐标点的分布模式

相关系数r：正相关、负相关、不相关

• misleading correlations：离群点- - →使相关系数r的计算出现偏差【多个值，可删去数据再分析】

芯片数据

• 横坐标：对照组 Ctrl

• 纵坐标：实验组 exp

• 点：代表某一个探针信号在不同样本中的一个强弱

• 线：fold change的阈值线（fold change =2）

  在线外：信号的倍数超过两倍，基因表达量具有显著差异

  红线一下，绿线以上：相关性非常好