用途:RNA-seq
一系列处理因素(不同的作用时间、不同的药物浓度……)下,测试数据中某些基因的表达变化趋势是相同或相似的,通过软件将其聚在一起- - - 趋势分析
趋势分析就是发现基因表达的趋势特征,将相同变化特征的基因集中在一种变化趋势中,从而找到实验变化过程中最具有代表性的基因群,揭示生物样本在变化过程中所特有的规律- - - - 可以进一步用KEGG、GO分析做功能分析
小正方形(趋势模块):每个小正方形代表一种 基因的表达趋势,里面包含一群相同表达趋势的基因- - - 这聚类叫 cluster/ profile
里面有一条趋势线【代表这个趋势模块里面所有基因的表达趋势 / 这个趋势模块里面所有基因表达量的一个均值 / 代表这个趋势模块里面某一个具有代表性基因 的表达趋势- - -- 据软件而定】
有时带有 P值:在左下角
有时会标注趋势模块富集了多少基因
颜色:表明P值是显著的;颜色相同,表明趋势相同
横坐标:时间 / 浓度 / 不同的组织样本 / 不同的处理因素
纵坐标:基因的表达值
[ ] 右边的图是左边某一个图的放大