微生物细胞内的代谢调节主要通过酶合成、酶活性、细胞膜透性的控制实现。
目的：最大限度积累对人类有用的代谢产物
措施：改变微生物遗传特性，控制生产过程中各种条件
实例：
初级代谢产物不同于次级代谢产物，微生物对于初级代谢的调节控制要比次级代谢控制要强烈的多，因此对于提高初级代谢产物产量的方法不同于次级代谢产物。
对发酵产物种类的影响主要是通过对酶的诱导和降解物阻遏的解除实现的。如，枯草杆菌既产淀粉酶，又产蛋白酶，提供葡萄糖，只产生蛋白酶
2）酶合成的反馈阻遏作用（feedback repression)
3）分解代谢物阻遏作用（catabolite repression)