人工核酸酶技术的发展使人为定点诱导DSBs成为现实，其中锌指核酸酶技术（zinc finger nucleases，ZFNs）就是一个里程碑式的突破，也称为第一代基因编辑技术。

ZFN 由锌指蛋白（zinc finger protein，ZFP）和 FokI 内切酶的核酸酶结构域组成，前者负责识别，后者负责切割 DNA。ZFP 是自然存在的蛋白结构，其由锌指结构（zinc finger，ZF）组成，ZF 能识别特定的 3 个连续碱基对，因此可通过串联 ZF 的数量调整 ZFN 的识别特异性。FokI 通过 N 端与 ZFP 连接，由于 FokI 以二聚体的形式发挥切割作用，ZFN 使用时需要成对设计。

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