<aside> ⛈️ 定义
Kozak序列是位于真核生物mRNA 5’端帽子结构后面的一段核酸序列,通常是GCCACCAUGG
,它可以与翻译起始因子结合而介导含有5’帽子结构的mRNA翻译起始。对应于原核生物的SD序列。存在于真核生物mRNA的一段序列,其在翻译的起始中有重要作用。
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<aside> ⛈️ 真核 Kozak序列和翻译起始的扫描模型
原核和真核生物mRNA翻译的重要组成元件是起始密码子AUG,但是mRNA的编码区也存在AUG。为什么第一个AUG能作为起始密码子而内部的AUG不能被起始翻译。其原因之一是第一个AUG的两侧翼序列是保守的序列,即AUG上游的-3位是A或G,下游+4位是G
。
大多数原核mRNA是多顺反子,每个多顺反子有自己的起始密码子和核糖体结合位点;而真核mRNA则多为单顺反子。在起始翻译时,40S nRNA通常面临着一个任务,即发现靠近转录物5′端的起始密码子。 Marilyn Kozak于1978年首次提出了翻译起始的第一个AUG规则和扫描模型。她根据如下实验结果:①真核mRNA翻译起始并不利用编码区内部的AUC;②从mRNA5′端起,翻译并不在一个固定的位点起始
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<aside> ⛈️ 规则
所谓Kozak规则,即第一个AUG侧翼序列的碱基分布所满足的统计规律,若将第一个AUG中的碱基A,U,G分别标为1,2,3位,则Kozak规则可描述如下:
(1)第4位的偏好碱基为G;
(2)AUG的5’端约15bp范围的侧翼序列内不含碱基T;
(3)在-3,-6和-9位置,G是偏好碱基;
(4)除-3,-6和-9位,在整个侧翼序列区,C是偏好碱基。
Kozak规则是基于已知数据的统计结果,不见得必须全部满足,一般来说,满足前两项即可 。
真核引物设计需在AUG前加上GCCACC
。
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