同源蛋白质的氨基酸序列具有明显的相似性称为序列同源性。

同源蛋白质一般具有几乎相同长度的多肽链，它们的氨基酸序列与那些提取它们的物种的亲缘关系具有同一性。

细胞色素c：在呼吸电子传递链中不可或缺的地位，其分子结构是相对保守的。

在进化位置上相距愈远，氨基酸顺序之间差别愈大

细胞色素c的氨基酸顺序分析资料已被用来核对各个物种之间的分类学关系，以及绘制进化树（系统发生树）

根据进化树不仅可以研究从单细胞有机体到多细胞有机体的生物进化过程，而且可以粗略估计现存的各类种属生物的分歧时间。