酵母双杂 (Yeast two-hybrid system) 交用于筛选存在相互作用的蛋白质

利用转录激活因子的DNA 结合域(DB)和转录激活域(AD)结合在一起才具有完整转录激活功能的原理

酵母双杂交(yeast two-hybridization)的基本原理是：

将目的蛋白与报告基因的DNA结合结构域构建成融合蛋白【目的蛋白通常称作诱饵(bait)】

将被筛选的蛋白与报告基因的转录激活结构域构建成融合蛋白【被筛选的蛋白通常称作俘获物(prey)】

如果目的蛋白和筛选的蛋白在酵母细胞中存在相互作用，则报告基因就会在酵母中进行表达，然后从阳性酵母菌落中分离出阳性蛋白的质粒就可以确定阳性蛋白的编码序列。

酵母双杂交能快速检测蛋白相互作用，包括相应的结构域，并找到相应的编码基因，是一种被广泛采用的，在体内(in vivo )条件下研究蛋白质相互作用的方法。但是酵母双杂交只能说明两个蛋白质之间有相互作用的结构基础，并不表示这两个蛋白质在细胞内一定会相遇或这种相互作用在活细胞确实存在，因此酵母双杂交确定的实验结果通常需要用免疫共沉淀进行验证。另外，酵母双杂交只是个筛选系统，并不能直接将蛋白质相互作用与特定的细胞功能联系起来。