存在自然界中的氨基酸约有180种，但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20余种(称为基本氨基酸)，且均属 L-α-氨基酸（脯氨酸，甘氨酸除外）。

180天然氨基酸包括蛋白质氨基酸,稀有氨基酸和非蛋白质氨基酸。

旋光性：(除Gly外)在旋光计上能使偏振光平面向左或向右旋转.右旋(+)、左旋(-)

旋光异构体：每一种氨基酸都有D或L型立体异构体

氨基酸的碳原子的编号

 根据与羧基碳原子的距离：将碳原子依次编号为〕α 、β 、γ 、δ 、ε 等。  用阿拉伯数字编号，从羧基的碳原子开始，依次编号为1、2、3、4等。

特殊氨基酸

• 脯氨酸（α-亚氨基酸）
• 甘氨酸（无旋光性）
• 半胱氨酸（二硫键）

20种氨基酸的分类和结构式------根据侧链R的结构和理化性质分类

20种氨基酸侧链的化学性质以及对蛋白质构象的贡献

• 甘氨酸：不含手性碳原子；立体位阻最小，破坏α-螺旋
• 丙氨酸、 缬氨酸、 亮氨酸、 异亮氨酸：不活泼；通过疏水作用紧密相连，稳定蛋白质构象
• 脯氨酸：位阻最大，中止α-螺旋
• 苯丙氨酸、 酪氨酸、 色氨酸：有紫外吸收，用于蛋白质定量检测
• 甲硫氨酸：硫原子易被氧化
• 半胱氨酸：巯基最活泼——与金属离子形成复合物；易被氧化形成链内或链间的二硫键
• 丝氨酸、 苏氨酸、 天冬酰胺、谷氨酰胺：不活泼；丝氨酸、苏氨酸发生磷酸化修饰
• 天冬氨酸、谷氨酸：酸性氨基酸，螯合金属离子；明显影响多肽链构象
• 赖氨酸：碱性氨基酸，发生甲基化修饰，
• 精氨酸：碱性氨基酸，体积大，离子化的胍基
• 组氨酸：碱性氨基酸，咪唑基是强亲核试剂，螯合金属离子