RNA pull-down 作为研究 RNA 与蛋白互作的核心技术，已成为研究焦点，是近年来研究IncRNA、circRNA与蛋白质相互作用的主要手段。其以RNA为主角，研究其与蛋白的互作。

RNA pulldown的原理：使用体外转录与生物素标记RNA，然后与细胞或组织的提取液进行孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物与链霉亲和素磁珠结合，通过磁分离与孵育液中的其他成份分离。再利用游离生物素竞争洗脱复合物，通过WB实验检测特定的蛋白是否与RNA相互作用，或者运用质谱筛选RNA结合的未知蛋白。