原核生物：多顺反子（polycistronic mRNA) 真核生物：单顺反子，断裂基因（splited gene)
真核生物mRNA结构特点
大多数真核mRNA的5´末端均在转录后加上一个7-甲基鸟苷，同时第一个核苷酸也可甲基化，形成帽子结构：m7GpppNm-。
大多数真核mRNA的3´末端有一个多聚腺苷酸 (poly A)结构，称为多聚A尾。
天然RNA分子多数是单链线形分子，只有部分区域是双螺旋结构。
[ ] t RNA
转运氨基酸，识别密码子，参与翻译起始，参与DNA的反转录，参与基因表达调控
tRNA的三级结构都为倒L形结构
tRNA都是小分子，长75－94个核苷酸，5’端有末端磷酸化基团，3’端为CCA-OH序列,分子中稀有碱基含量较高，而且许多被甲基化修饰；分子内部有碱基互补区，都能形成三叶草形二级结构。该二级结构一般由氨基酸接受臂、二氢尿嘧啶环（D环）、反密码子环和TψC环组成，有的还在反密码子环和TψC环之间存在额外环。
[ ] r RNA
组成核糖体，催化肽键形成的转移酶活性存在于23S rRNA上，参与tRNA与mRNA的结合
大肠杆菌5S rRNA的二级结构模型
组成：5个双螺旋区和其他单链区；
两个功能域：一个功能域中含有 5’CGAAC序列，这是与tRNA分子TψC 环上的GTψCG序列相互作用的部位， 使tRNA与核糖体结合。
另一个功能域与23S rRNA中的一段 序列互补，对核糖体大亚基与rRNA的 相互作用有重要意义。
四个功能域：5′端功能域、中心功能域、3′末端大功能域、3′末端小功能域