接下来,就用Nextera方法,对扩增好的片段,进行打断,并加上末端标签。
Nextera打断的原理,是用结合了DNA标签的转座酶,和之前扩增得到的10KB的DNA片段进行反应。
转座酶,一方面,会把长片段给切断成短的小片段。
另一方面,它也会把酶本身结合了的DNA标签,连在切出来的小片段DNA的末端上。
这个新加上的DNA标签,就成了接下来PCR扩增的引物结合序列。
再接下来,就是加入有P5、P7测序引物序列,同时带有Index序列的PCR引物,进行新的一轮PCR扩增。
那么这一轮PCR扩增的结果,就会把Index序列,和P5、P7测序引物序列都加到扩增出来的DNA片段上。
这一轮的扩增完成之后,我们就得到的,就是384个带了完整的接头序列、Index序列的文库。
再接下来,就把这384个文库混合在一起,用柱子进行回收。
然后,就可以用Illumina测序仪进行测序了。