ddSEQ System是单细胞分析的新一代测序(NGS)工作流程,可一次性检测8个样本,每个样本可以得到500~10000个细胞,研究单细胞在组织功能、病情进展和治疗反应方面的协同作用。与其他高通量捕获平台相比:Illumina® Bio-Rad®捕获效率低,仅为3%,但测序成本相对较低。

原理:借助Bio-Rad的Droplet Digital™液滴分离技术,该平台可对单个细胞进行隔离和编制条形码,完成单细胞的捕获、扩增、表达谱建库,然后在Illumina NextSeq500仪器进行下游测序,从而获得单个细胞表达谱数据。

https://s3-us-west-2.amazonaws.com/secure.notion-static.com/583a4043-96d2-473a-a407-48c1016c40c6/Untitled.png

https://s3-us-west-2.amazonaws.com/secure.notion-static.com/e5c6293e-03e4-4136-9a49-4b5f6c24ffc5/Untitled.png

优点:操作简单、一次性可8个样本,捕获500~10000个单细胞,成本较低

缺点:捕获效率低;只能得到3’端的mRNA信息。