2012年6月13日，Fluidigm 在日本横滨举行的国际干细胞研究学会 (ISSCR ) 上发布了C1™ 单细胞全自动制备系统，是真正第一个实现商业化的平台。C1 系统基于Fluidigm创新的微流体技术，能够让研究者们快速可靠地分离单个细胞并进行分析。

原理：C1单细胞自动制备系统微流控技术，可以同时捕获多个单细胞（IFC：~96 cells；HT-IFC：~800 cells），在同一张芯片上完成细胞捕获、裂解、逆转录及预扩增的全过程；然后BioMarkHD系统进行qPCR扩增，在几个小时内即可测试数以百计的单细胞中数百个基因的表达。

微流控技术原理

应用领域：

该平台可获得单细胞全转录组信息，可应用于生殖发育、干细胞分化、检测单一细胞对特定刺激的反应、证实重要疾病生物标志物、验证RNA干扰沉默基因表达和实行候选药物筛选等研究领域。

优点：

• 稳定的细胞捕获平台，可同时捕获至多96个细胞；
• 分选单细胞之后可支持不同测序方法，可以获取到转录组的全长信息
• 人工技术要求较低；
• 实验周期短（96个细胞只需数小时）；
• 获得mRNA全长数据，基因检出率高；
• 缺乏质控点。

缺点：

• 细胞通量低；
• 成本较高。

适用范围：

• 少量样本研究；
• 直径在5-25μm的细胞。