BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System采用了Cytoseq分子标签技术，能为单细胞中每个转录本标记特异性分子标签，**实现单细胞水平上基因表达谱的绝对定量。**同时，每个细胞也会被标记特异性细胞标签，使得高通量平行建库成为可能。结合Rhapsody特有的单细胞分离技术，单次实验可制备100-10000个单细胞文库，用户可根据需求定制引物，将检测范围集中在目标基因，大幅降低后续测序成本。

原理：基于 蜂巢板，scanner检测 的扩增和测序

蜂巢板上每个孔的大小比一个细胞稍微大一些，可以同时放下一个细胞和一个凝胶微珠。它的操作是细胞悬液基于微流控芯片技术经注入孔注入后，自然沉降到反应孔中，随后， Beads 同样由注入孔注入，即可在单个反应孔中捕获其中的细胞。

这里的 Beads 是刚性 Beads，捕获后在低温条件下可以保存3个月。Beads 上的序列结构与 10X Genomics 相似，可以捕获到游离 mRNA 的 polyA 尾。然后洗去多余的凝胶微珠，从而达到单细胞捕获的目的。

但是这样的操作会导致有的蜂巢孔是空的，而有的进去两个细胞，所以该系统装备了成像系统，在细胞捕获后，即可直观的看到细胞捕获数、细胞状态等信息。当这些统计的指标都是PASS的时候，就说明此次单细胞捕获是合格的，可以进行后续的操作了。

优势：

• 平台成本低，通量高；
• 可通过屏幕监控进行细胞质控；
• 平台较为开放，利于个性化研发（靶向捕获）。
• 实现多样本混合捕获，微孔板的孔数高达22万个；具备成像系统，可观察细胞相关信息；可以实现转录组-蛋白组联合分析。

缺点：

• 对细胞总量要求较高；
• 为3’测序，基因检测率不及SMART-seq等全长测序；
• 操作步骤较多。

适用范围：

• 直径<20μm的细胞（受磁珠结合效率限制）。
• 大规模细胞样本，适用于分群、谱系等研究。