• 发展

<aside> 🍁 DNA芯片（DNA chip）

基因芯片又称DNA芯片或DNA微阵列，是基于核酸互补杂交原理将大量的探针分子按二维结构固定于固相支持物上而形成的测序集成块，与标记的样品分子进行杂交反应，通过对杂交信号的监测分析获取样品分子的数量和序列信息。

标记靶序列产生取决于杂交条件（如温度)；信号总强度取决于目标样本与该点存在的探针结合的数量

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• [ ] 基因芯片 类型

  • 制备方法

    • 原位合成芯片：采用显微光蚀刻技术在芯片的特定部位合成寡核苷酸而制成芯片；合成的寡核苷酸链较短，密度较高
    • 直接点样芯片：将预先制备的DNA片段以显微打印的方式有序地固化于支持物表面；片段较长，密度较低

  • 探针类型

    	cDNA芯片	寡核苷酸芯片
    DNA类型	cDNA	寡核苷酸
    DNA长度	500-3000bp	小于80bp
    DNA制备	PCR产物	预合成或原位合成
    探针与芯片的连接方式	共价键或离子键	共价键
    用途	RNA的表达分析	RNA的表达监控、核酸序列分析

    • cDNA芯片
    • Oligo芯片
    • 原位合成芯片
• [ ] 应用
  • 寻找关键基因
  • 药物筛选
  • 疾病诊断
• [ ] 问题
  • 高度地依赖已知信息;
  • 高背景噪音，非特异性杂交带来的无法分辨弱信号和信号过饱和的问题
  • 在不同样品的比较当中，甚至在同一芯片内部，都存在杂交不均匀带来的各种问题，需要标准化等统计学方法来对结果校正
  • 不可能对可变剪切进行分析