催化三联体具体功能是: 1 Ser195充当进攻底物的亲核基团; 2 His57作为广义的酸碱催化剂; 3 Asp102 的功能仅仅是定向His57,影响His的 pKa,改变其酸碱性质。
酶结合底物后,从Ser转移一个质子给His,带正电荷的咪唑基通过带负电荷的Asp 静电相互作用被稳定。
催化口袋的比较
胰蛋白酶
具有很深的底物结合口袋,而口袋的底部又是Asp
特别适合长的碱性氨基酸侧链(Lys和Arg)的结合
胰凝乳蛋白酶
宽,而且口袋壁分布的是疏水氨基酸
特别适合芳香族氨基酸的结合
弹性蛋白酶
结合口袋非常浅
适合结合侧链较小的氨基酸残基
——特异性的 体现