人类、动物、植物的全基因组序列分析往往需要克隆数百甚至上千kb 的DNA片段，此时考斯质粒的装载量也远远不能满足需要。

将细菌接合因子或酵母菌染色体上的复制区、分配区、稳定区与质粒组装在一起，即可构成染色体载体。当大片段的外源DNA克隆在这些染色体载体上后，便形成重组人造染色体【基于ARS、CEN、TEL是线性染色体稳定的功能序列，人们利用这些序列构建载体，重组后的DNA以线性状态存在，这样不仅稳定，而且大大提高了插入外源基因的能力，并且可以像天然染色体一样在寄主细胞中稳定复制和遗传，故称为人工染色体】，它能像天然染色体那样，在受体细胞中稳定的复制并遗传。

类型：

细菌人造染色体( Bacterial Artificial Chromosomes，BAC)

细菌人造染色体通常是在大肠杆菌性因子F质粒的基础上构建的，命名为pBACs，其装载量范围在50-300 kb之间。各种类型的pBACs在大肠杆菌受体菌中只能维持单一拷贝

pBACs主要适用于：克隆大型基因簇（gene cluster)结构、构建动植物基因文库

噬菌体人造染色体（PAC)

人类人造染色体（HAC)

酵母人工染色体（Yeast Artificial Chromosomes, YAC）

YAC：TEL（端粒序列）、CEN（着丝粒序列）、ORI（自主复制序列）、选择标记

够承载较大的外源基因，并且保持线性人工染色体的稳定复制和遗传。

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