一代测序:一代测序主要可以分成双脱氧链终止法(又称Sanger法)和化学降解法。

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(1)双脱氧链终止法

ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,不具有与另一个dNTP连接形成磷酸二酯键的能力,这些ddNTP可用来中止DNA链的延伸,使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止;此外,这些ddNTP上连接有放射性同位素或荧光标记基团。终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整,使反应得到一组长几百至几千碱基的链终止产物。它们具有共同的起始点,但终止在不同的的核苷酸上,可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段,凝胶处理后可用X-光胶片放射自显影非同位素标记进行检测

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(2)化学降解法

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马克西姆(Maxam)和吉尔伯特(Gilbert)

Maxam-Gilbert 化学降解法

原理为:

值得注意的是,就在测序技术起步发展的这一时期中,除了Sanger法之外还出现了一些其他的测序技术,如焦磷酸测序法、链接酶法等。其中,焦磷酸测序法是后来Roche公司454技术所使用的测序方法,而连接酶测序法是后来ABI公司SOLID技术使用的测序方法,但他们的共同核心手段都是利用了Sanger1中的可中断DNA合成反应的dNTP。